Durante el siglo XV, el Reino de Chipre fue un Estado Cruzado, gobernado por la Casa Francesa de Lusignan. Durante el periodo comprendido entre 1192 y 1489, se utilizó un estandarte que contenía las armas de los Reinos de Jerusalén, Chipre y Armenia.

En 1489, Venecia tomó al Estado cruzado de Chipre. El objetivo fue bloquear el poder del Imperio otomano, que se expandía.

Un año después, los venecianos abandonaron por completo la isla. Desde 1489 y hasta 1571, al ser parte del territorio de la República de Venecia, Chipre era identificado con la bandera de esta República.

A partir de 1571, pasó a ser parte del territorio del Imperio otomano, estuvo representada bajo sus banderas.

En 1878, la guerra ruso-turca (guerra de Oriente), finalizó con el control otomano.

Un acuerdo secreto realizado el 4 de junio de 1878 entre Reino Unido y el Imperio otomano, concedió el poder sobre Chipre a Gran Bretaña con la condición de que esta apoyara a los otomanos durante el Congreso de Berlín.

Al convertirse en una colonia de la Corona británica, se creó una nueva bandera que se mantuvo vigente hasta 1960.

El origen de la bandera actual fue el resultado de un concurso. Adoptada el 16 de agosto de 1960 y modificada el 24 de abril de 2006. Muestra un mapa entero de la isla de color cobre con dos ramas de olivo en la parte de abajo, sobre fondo blanco. Elegida por el presidente de la República, Makarios III, tras una propuesta de un maestro de escuela turcochipriota, İsmet Vehit Güney.

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